جزوه طراحی پرايمر با فرمت word

دانشجویان و کاربران گرامی ، محتوای این فایل جامع ترین و بهترین جزوه طراحی پرايمر با فرمت word بصورت تصویری در 18 صفحه می باشد .امیدواریم که سودمند بوده و مورد استفاده شما سروران گرامی واقع گردد. در صورت تمایل و نیاز می توانید این فایل ارزشمند و مفید را از وب سایت سن فایل با مناسب ترین قیمت خریداری و دانلود نمایید.

بخشی از متن جزوه طراحی پرايمر :

اولين و اساسي ترين قدم در تکثير يک قطعه خاص DNA، و انجام PCR ، طراحي پرايمر است. جهت انجام اين کار رعايت نکات زير ضروري مي باشد:

• طول پرايمر ها بايد بين 20 تا 25 نوکلئوتيد باشد (در بعضی مواقع طول 18 تا 25 نیز کاربرد دارد). طول کمتر، اتصال پرايمر به توالي هدف را سست مي کند و طول بيشتر، اين اتصال را دشوار مي سازد، که در هر دو مورد مقدار محصول شديدا کاهش مي يابد.
• پرايمر هاي طراحي شده بايد تنها يک قطعه DNAيي، يعني همان توالي مورد نظر را تکثير کنند و به هيچ بخش ديگري از کل DNAي ژنومي متصل نشوند.
• دماي annealing دو پرايمر بايد نزديک به هم باشد و تفاوت چنداني با هم نداشته باشند.
• هر دو پرايمر از نظر درصد GC بايد در يک range قرار داشته باشند.
• پرايمر ها بايد از نظر درصد GC در حد نرمال باشند، (بين 30 تا 55)، درصد بيشتر GC، شرايط PCR را دشوار مي کند و درصد کمتر اتصال پرايمر به توالي هدف را سست و ميزان محصول را کاهش مي دهد.
• پرايمر ها نبايد تشکيل Hair-pin بدهند.
• پرايمر ها در دماي نزديک به دماي annealing ، تشکيل Self-Dimer ندهد.
• پرايمر ها در دماي نزديک به دماي annealing، با يکديگر تشکيل Hetero-Dimer ندهند.

به منظور طراحي پرايمر براي يک قطعه ي خاص، ابتدا لازم است اطلاعات مربوط به ژن مورد نظر و يا اگزون مربوطه را به دست بياوريم. ژن مورد نظر (مثلا ژن CLDN14) را در سايتGenome Browser  UCSC ، جستجو مي کنيم.