جزوه طراحی پرايمر با فرمت word

دانشجویان و کاربران گرامی ، محتوای این فایل جامع ترین و بهترین جزوه طراحی پرایمر با فرمت word بصورت تصویری در ۱۸ صفحه می باشد .امیدواریم که سودمند بوده و مورد استفاده شما سروران گرامی واقع گردد. در صورت تمایل و نیاز می توانید این فایل ارزشمند و مفید را از وب سایت سن فایل با مناسب ترین قیمت خریداری و دانلود نمایید.

بخشی از متن جزوه طراحی پرایمر :

اولین و اساسی ترین قدم در تکثیر یک قطعه خاص DNA، و انجام PCR ، طراحی پرایمر است. جهت انجام این کار رعایت نکات زیر ضروری می باشد:

• طول پرایمر ها باید بین ۲۰ تا ۲۵ نوکلئوتید باشد (در بعضی مواقع طول ۱۸ تا ۲۵ نیز کاربرد دارد). طول کمتر، اتصال پرایمر به توالی هدف را سست می کند و طول بیشتر، این اتصال را دشوار می سازد، که در هر دو مورد مقدار محصول شدیدا کاهش می یابد.
• پرایمر های طراحی شده باید تنها یک قطعه DNAیی، یعنی همان توالی مورد نظر را تکثیر کنند و به هیچ بخش دیگری از کل DNAی ژنومی متصل نشوند.
• دمای annealing دو پرایمر باید نزدیک به هم باشد و تفاوت چندانی با هم نداشته باشند.
• هر دو پرایمر از نظر درصد GC باید در یک range قرار داشته باشند.
• پرایمر ها باید از نظر درصد GC در حد نرمال باشند، (بین ۳۰ تا ۵۵)، درصد بیشتر GC، شرایط PCR را دشوار می کند و درصد کمتر اتصال پرایمر به توالی هدف را سست و میزان محصول را کاهش می دهد.
• پرایمر ها نباید تشکیل Hair-pin بدهند.
• پرایمر ها در دمای نزدیک به دمای annealing ، تشکیل Self-Dimer ندهد.
• پرایمر ها در دمای نزدیک به دمای annealing، با یکدیگر تشکیل Hetero-Dimer ندهند.

به منظور طراحی پرایمر برای یک قطعه ی خاص، ابتدا لازم است اطلاعات مربوط به ژن مورد نظر و یا اگزون مربوطه را به دست بیاوریم. ژن مورد نظر (مثلا ژن CLDN14) را در سایتGenome Browser  UCSC ، جستجو می کنیم.

ادامه مطلب